目前，云百草实验室成功地分离出虫草菌株7,000余株，涉及到虫草无性型菌株，12个属50余个种；其中包括冬虫夏草O. sinensis菌株446株，阔孢虫草O. crassispora菌株26株，横断山虫草E. hengduanensis菌株154株，凉山虫草C. liangshanensis菌株66株，黔虫草M. indigotica菌株79株，罗伯茨虫草O. roberstii菌株43株，兰坪虫草O. lanpingensis菌株82株，蝉棒束孢I. cicadae菌株352株，古尼虫草C. gunnii菌株62株，蛹虫草C. militaris菌株172株，垂头虫草O. nutans菌株8株，粉被虫草C. pruinosa菌株10株，双梭孢虫草C. bifusispora菌株1株，奇异虫草E. paradoxa菌株2株，大团囊虫草E. ophioglossoides菌株1株，Pol. cuboideus菌株1株，Pol. prolificus菌株10株，云南多头霉Pol. yunnanensis菌株12株，中国多头霉Pol. sinensis 菌株71株，球孢白僵菌B. bassiana 菌株40株，布氏白僵菌B. brongniartii菌株 3株，亚洲白僵菌B. asiatica 菌株1株，拟球孢白僵菌B. pseudobassiana菌株 4株，苏格兰白僵菌B. caledonica 菌株1株，Beauveria cf. sungii 菌株2株，粉棒束孢I. Farinosa 菌株62株，鲜红棒束孢I.amoenerosea 菌株19株，环链棒束孢I. cateniannulata 菌株3株，枚烟色棒束孢I. fumosorosea 菌株15株，细脚棒束孢I. teniupes 菌株41株，蜂头虫草O. sphecocephala菌株2株，巴恩斯虫草O. barnesi菌株5株，细虫草O. gracilis菌株2株，头状虫草E. capitata菌株3株，其他虫草菌株1,000余株。